Multi-jonoinvertteri hyödyntää merkkijonoinvertterin edut, välttää sen puutteet, ja sitä voidaan käyttää useiden kilowattien aurinkosähkövoimaloissa. Moni-jonoinvertteri sisältää erilaisia yksittäisiä tehohuippujen seurantaa ja DC-to-DC-muuntimia. Nämä DC:t muunnetaan vaihtovirtalähteeksi tavallisella DC-to-AC-invertterillä ja liitetään verkkoon. Aurinkosähköjonojen eri nimellisarvot (kuten: eri nimellisteho, eri komponenttien lukumäärä kussakin merkkijonossa, eri valmistajat komponentteja jne.), erikokoisia tai eri tekniikoita olevia aurinkosähkömoduuleja ja eri suuntaisia jonoja (esim.: itä, etelä ja länsi), eri kaltevuuskulmat tai varjot, voidaan kytkeä yhteiseen maksimitehoon, ja jokaiseen vastaavaan invertteriin toimii.
Samalla DC-kaapelin pituus pienenee, varjovaikutus merkkijonojen välillä ja merkkijonojen välisestä erosta johtuva häviö minimoidaan.
